Surgiu quando uma expedição organizada pelo capitão Antônio Gonçalves Figueira buscava ligar Montes Claros ao rio Gorutuba e aos currais da Bahia. A expedição alcança a região próxima a serra do Catuni, às margens de uma pequena lagoa. Ali, o capitão e seus homens montam acampamento e erguem uma cruz, marcando o futuro município de Brejo das Almas, atual Francisco Sá. Brejo das Almas possuía um distrito chamado Bururama.

O topônimo é em homenagem a Capitão Enéas, um benemérito local.

Elevado à categoria de município e distrito com a denominação de Burarama de Minas, pela Lei Estadual n.º 2.764, de 30/12/1962, desmembrado de Francisco Sá. Sede no atual distrito Burarama de Minas (ex-povoado). Constituído de 2 distritos: Burarama de Minas e Caçarema, este último criado pela mesma lei acima citada. Instalado em 01/03/1963.

Em divisão territorial datada de 31-XII-1963, o município é constituído de 2 distritos: Burarama de Minas e Caçarema.

Pela Lei Estadual n.º 3.973, de 15/12/1965, o município de Burarama de Minas passou a denominar Capitão Enéas. Assim permanecendo em divisão territorial datada de 1999. Pela Lei Estadual n.º 1, de 20/12/2001, é criado o distrito de Santana da Serra e anexado ao município de Capitão Enéas.

Em divisão territorial datada de 2003, o município é constituído de 3 distritos: Capitão Enéas, Caçarema e Santana da Serra. Assim permanecendo em divisão territorial datada de 2017.

Fonte: cidades.ibge.gov.br/brasil/mg/capitao-eneas/histórico