O povoamento de Nipoã deu-se na passagem do século XIX para o XX, e a sede do município tem sua origem nas terras da grande fazenda Boa Vista da Cachoeira do Avanhandava, de propriedade dos irmãos Oliveira. Efetivamente, em 1904 eles fizeram a doação à Igreja de alguns alqueires margeantes ao ribeirão das Oficinas, visando à instalação de uma capela com o respectivo erguimento de um cruzeiro; e estes foram os marcos iniciais do patrimônio, que então se estabeleceria, formado, inicialmente, pelos trabalhadores das terras dos próprios Oliveira e seus agregados.

Em 1923 o lugar já ostentava o título de distrito, com o nome emprestado da fazenda em que nasceu, isto é, Boa Vista da Cachoeira do Avanhandava. A denominação atual veio apenas com a sua emancipação do município de Monte Aprazível, em 30 de dezembro de 1937, e significa campo redondo ou campina redonda; para nhu (campo, campina) e apuã (redondo), do tupi.

O motivo do nome, a propósito, não se deve, stricto sensu a nehuma campina arredondada, em particular, mas às terras planas em que se situa o município e que se constituem, predominantemente, em pastagens.

Fonte: (livro) A origem dos nomes dos municípios paulistas, Enio Squeff e Helder Perri Ferreira, 2003, pg. 197.