A região tem seu desbravamento ligado ao ciclo do ouro, que foi intensificado quando os bandeirantes atingiram o rio Paraibuna. Durante as primeiras décadas do séc. XVIII formaram-se os núcleos de N.S. de Monte Serrat, N. S. de Bemposta e São Sebastião de Entre Rios. A partir da inauguração da rodovia União e Indústria, em 1858, a localidade de Entre Rios passou a ser beneficiada por vários melhoramentos. Em 1867, com a implantação da Estrada de Ferro D. Pedro II, cruzando com a estrada de rodagem no local, o núcleo também se tornou importante entroncamento rodoferroviário.

Apesar do progresso, somente após o período republicano foi criado o distrito de Entre Rios (1890), que juntamente com o Monte Serrat, Areal e Bem-Posta fazia parte do município de Paraíba do Sul. Com o decreto de 14 de dezembro de 1938, esses distritos foram desmembrados daquele município e constituíram o município de Entre Rios. Em 1943, o topônimo Entre Rios foi mudado para Três Rios e o distrito de Monte Serrat foi extinto, passando o seu território a fazer parte do recém criado distrito de Afonso Arinos.